La Universidad Autónoma de Encarnación - UNAE participa activamente en la asignatura internacional “Investigación Aplicada a la Transformación de la Salud Integral en Latinoamérica”, una propuesta académica de la Universidad de Concepción (UdeC, Chile), dirigida por la Dra. Sigrid Mennickent Cid, directora del Departamento de Farmacia.

La Universidad Autónoma de Encarnación – UNAE, a través de la Facultad de Ciencias Veterinarias y Agrícolas - FACVA, mantiene desde mayo de 2024 un convenio de cooperación institucional con la Dirección Nacional de Defensa, Salud y bienestar Animal, dependiente del Estado paraguayo, orientado al desarrollo de acciones conjuntas de formación, investigación y extensión comunitaria en el ámbito del bienestar y la salud animal.

El miércoles 22 de octubre de 2025, en el marco de la nueva edición del Premio Nacional Juvenil de Ciencias “Pierre et Marie Curie”, impulsado por el Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (CONACYT), la Embajada de Francia, la Alianza Francesa y el Ministerio de Educación y Ciencias (MEC), estudiantes del Colegio Privado Divina Esperanza fueron seleccionados para representar a la institución con destacados proyectos científicos.

La carrera de Licenciatura en Análisis de Sistemas Informáticos, dependiente de la Facultad de Ciencias, Arte y Tecnología (FACAT) de la Universidad Autónoma de Encarnación (UNAE), se destacó por su papel protagónico en el desarrollo del proyecto “Tecnología para el desarrollo del sistema de salud local”, cuyos resultados fueron presentados recientemente en la Sala de Consejo de la UNAE.